解释三种经典动物模型的“肠道密码”

报纸（Diao Wenhui记者）是Ma Yingfei的团队，他是中国科学院科学院的研究人员，系统地发现了小鼠和动物，包括Cynomolgus猴子在内的小鼠和动物中肠道噬菌体的组成和分布规则。相关研究结果最近发表在微生物组中。使用生物信息学方法，该设备有效地标准化了约1,500只小鼠，猪和cinomorgas猴子的肠道宏基因组学，并成功地建立了977种模型动物的高质量数据库，包括977只小鼠，12,896只猪和1,480 Canomugars Monkos。这种比较发现，大多数病毒序列属于尾噬菌体，从而显着增加了模型动物肠噬菌体的多样性。基于基因组编码蛋白的相似性，该团队在上述病毒序列中确定了71组高度分布的病毒，分布率超过60％。其中，国际病毒分类委员会分类为五个病毒群，分类病毒的分布率最高，这表明模型动物中的肠道噬菌体可以具有异发学科传播。该团队在数据库中的三个组中确定了315个噬菌体与该类别类似的噬菌体，其中182个与该家族的伯氏家族密切相关，无论已知类型如何，都形成了部分新的分支。此外，研究人员还确定了肠数据库中基因组长度大于200 kb的245个巨型噬菌体。值得注意的是，由这些噬菌体编码的CAS14蛋白具有完整的结构，最小的噬菌体仅包含153个氨基酸，可以开发新的工具基编辑。为了研究模型动物与人类肠道微生物之间的相关性，设备发现，通过核酸和蛋白质水平，Cinomolgus Monkeys的肠道微生物群类似于小鼠和猪的人类微生物群。在CRISPR间隔者的巧合分析中，cynomolgus mono数据库的巧合成功率超过50％，cynomolgus猴子可以实现巧合的成功率。它还证实，研究人类肠道微生物是一种更理想的动物模型。这项研究扩大了模型动物肠噬菌体的多样性，并为肠道微生物生态学的研究提供了宝贵的参考资源，以及随后开发新的噬菌体疗法工具和基因版的基础。将来，这项研究的范围将在肠道RNA的病毒领域扩展，并可能研究噬菌体的功能机制及其与客人的相互作用，并且预计它将在肠道病毒群落的医疗应用领域取得更大的进步。相关文档中的信息：https：//doi.org/10.1186/s40168-025-02144-4